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SUPER Green I 與 dsDNA 結(jié)合熒光信號(hào)可增強(qiáng) 800～1000 倍。在 PCR 反應(yīng)體系中， 加入過量 SUPER Green I 熒光染料，它特異性地?fù)饺?DNA 雙鏈后，熒光信號(hào)增強(qiáng)，而不 摻入鏈中的 SUPER Green I 染料分子熒光不變，從而保證熒光信號(hào)的增加與 PCR 產(chǎn)物的 增加完全同步。熒光可以在退火階段或者延伸階段測(cè)定。

1.使用濃度對(duì)熒光 PCR 結(jié)果的影響

SUPER Green I 的使用濃度是保證熒光定量 PCR 實(shí)驗(yàn)成功非常關(guān)鍵的因素。如果 SUPER Green I 的濃度過低會(huì)使熒光信號(hào)的變化降低，這就意味著低拷貝的樣品可能無 法檢出。而在高濃度時(shí)，將會(huì)抑制 PCR 反應(yīng)，降低 PCR 反應(yīng)效率。所以一般在使用 SUPER Green I 時(shí)應(yīng)根據(jù)實(shí)際情況優(yōu)化使用濃度，反應(yīng)的終濃度為 1×到 0.2×之間。

2.Mg2+濃度的影響

提高 Mg2+濃度可以降低 SUPER Green I 對(duì) PCR 反應(yīng)的抑制作用。我們建議在用 SUPER Green I 進(jìn)行熒光 PCR 反應(yīng)時(shí)，Mg2+濃度比無 SUPER Green I 的普通 PCR 反應(yīng)高出 0.5～ 3mM。